定量蛋白质组-同位素标记相对和绝对定量
同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术是最新开发的蛋白质组学技术,具有定量好、重复性高等优点,可对多达八种不同样本进行分析,详情请参看公司网站:http://www.oceanelf.com
定量蛋白质组学——Label Free
非标记定量蛋白质组学(Label Free)是近年来比较常见的一种对样本中蛋白质进行大规模相对定量分析的分析方法。
单一蛋白的高覆盖度分析
iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析 Label Free非标定量分析 半定量分析(spectral count) 鸟枪法蛋白全谱分析 2D蛋白胶点鉴定 单一蛋白高覆盖度分析
iTRAQ
在质谱图中,任何一种iTRAQ试剂标记的不同样本中的同一蛋白质表现为相同的质荷比。而在串联质谱中,信号离子表现为不同质荷比(114~117)的峰,因此,根据波峰的高度及面积,可以得到蛋白质的定量信息。
蛋白质相互作用网络分析
蛋白质相互作用网络中信号流向方向预测;根据网络的拓扑性质,挖掘网络重要节点(如hub节点,crosstalk节点);根据功能信息注释,进行网络模块化
磷酸化蛋白质鉴定和定量
对样本进行酶解,TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,计算出磷酸化位点。磷酸化蛋白选择iTRAQ定量或SWATH定量